Informace o projektu
Česká národní infrastruktura pro biologická data
(ELIXIR-CZ)
- Kód projektu
- LM2018131
- Období řešení
- 1/2020 - 12/2022
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Ústav výpočetní techniky
- prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
- RNDr. Matej Antol, Ph.D.
- Mgr. Adam Bodnár
- Ing. Radoslav Čerhák
- Mgr. Ivana Křenková
- Mgr. Slávek Licehammer
- prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
- Mgr. Zdeněk Salvet
- WWW stránky projektu
- https://www.elixir-czech.cz/
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba RNDr. Jiří Vondrášek, CSc.
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Univerzita Karlova
Univerzita Palackého v Olomouci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
Západočeská univerzita v Plzni
České vysoké učení technické v Praze
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Biotechnologický ústav AV ČR, v.v.i.
It is a current global trend that life science experiments generate an immense and steadily increasing volume of data. The Czech Republic feels this trend very strongly, because several new life science infrastructures were successfully established here, and they produce large amounts of data. It is necessary to store the data, safely manipulate with them, efficiently extract key information, etc. ELIXIR CZ is an infrastructure which is prepared to accept this challenge.
Thus, ELIXIR CZ aims to create a sustainable infrastructure for storing, processing and analysis of life science data in the Czech Republic. It will also provide tools and training that will facilitate performing these activities. Currently, ELIXIR CZ involves thirteen institutions - nine life science research centres and two IT infrastructures. ELIXIR CZ also creates a communication platform for life science research institutes in the Czech Republic. ELIXIR CZ is a node of the European ESFRI project ELIXIR and is strongly involved in its activities. The ELIXIR project was approved by the Competitiveness Council from ESFRI as one of three prioritised Research Infrastructures.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 34
2023
-
SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index
Similarity Search and Applications. SISAP 2023. Lecture Notes in Computer Science, vol 14289, rok: 2023
-
sMolBoxes: Dataflow Model for Molecular Dynamics Exploration
IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, rok: 2023, ročník: 29, vydání: 1, DOI
-
Telomerase RNA in Hymenoptera (Insecta) switched to plant/ciliate-like biogenesis
Nucleic acids research, rok: 2023, ročník: 51, vydání: 1, DOI
2022
-
CF Day Meeting
Rok: 2022, druh: Popularizační texty
-
Computer-aided engineering of staphylokinase toward enhanced affinity and selectivity for plasmin
Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2022, ročník: 20, vydání: May 2022, DOI
-
CoverView: clear atom-level visualization of electron density coverage of PDB structures to assist validation
Rok: 2022
-
Large-scale randomness study of security margins for 100+ cryptographic functions
Proceedings of the 19th International Conference on Security and Cryptography, rok: 2022
-
Learned Indexing in Proteins: Extended Work on Substituting Complex Distance Calculations with Embedding and Clustering Techniques
Rok: 2022
-
Learned Indexing in Proteins: Substituting Complex Distance Calculations with Embedding and Clustering Techniques
Similarity Search and Applications, 15th International Conference, SISAP 2022, Bologna, Italy, October 5–7, 2022, Proceedings, rok: 2022
-
Validation of cycle conformation in small molecules
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty